Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Issue 5
Investigation of Rotavirus, Adenovirus and Astrovirus in Mussels and Shrimps Using Multiplex Real-time PCR
Farouk GHALYOUN1, Ayla ÜNVER ALÇAY2
1Istanbul Aydin University, Institute of Natural and Applied Sciences, Department of Food Safety, TR-34513 Esenyurt, Istanbul - TURKEY
2Istanbul Aydin University, ABMYO, Food Technology Program, Florya Main Campus, TR-34295 Sefakoy/Kucukcekmece, Istanbul - TURKEY
DOI : 10.9775/kvfd.2018.19997 Viruslar gıda vasıtasıyla en yaygın bulaşan patojenlerden biridir. Epidemiyolojik bulgulara göre insana ait enterik viruslar kabuklu deniz ürünleri vasıtasıyla en çok aktarılan etiyolojik ajan olarak tanımlanmaktadır. İstanbul"da balıktan sonra en çok tüketilen deniz ürünleri midye ve karidestir. Bu çalışmada, İstanbul kıyılarında avlanarak tüketilen midye ve karides numunelerinde rotavirus, adenovirus ve astrovirus varlığı araştırılmıştır. Bu amaçla toplam 28 karides ve 52 midye grubu İstanbul"un farklı yerlerinden toplanmıştır. Her bir grup ayrı bir numune olarak analize alınmıştır. Viruslar glisin/NaCl, pH 9.5 tamponu kullanarak direkt elüsyon metodu ile doğrudan sindirim dokusundan ayrıştırılmış ve PEG-6000 ile konsantre edilmiştir. Alınan midye ve karides numuneleri Multiplex Real-time PCR yöntemi ile analiz edilmiştir. Toplam çalışılan 52 midye numunesinin %46.15"inde adenovirus ve %63.46"sında astrovirus saptanmıştır. Rotavirus hiçbir midye numunesinde tespit edilmemiştir. Karides numunelerinin hiçbirinde araştırılan virusların hiçbiri saptanmamıştır. Bu, Türkiye"deki midyelerde ve karideslerde rotavirus, adenovirus ve astrovirus prevalansı hakkındaki ilk rapordur. Sonuçlar, İstanbul"da satılan midyelerin adenovirus ve astrovirus ile kontamine olduğunu ve bu durumun halk sağlığı için büyük bir tehdit oluşturabileceğini göstermektedir. Keywords : Midye, Karides, Rotavirus, Adenovirus, Astrovirus, RT-PCR